上新│Cas12a:CRISPR工具箱中的新星!-技术前沿-资讯-生物在线

上新│Cas12a:CRISPR工具箱中的新星!

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2024-05-15T00:00 (访问量:34354)

 

2023年11月16日,Vertex Pharmaceuticals和CRISPR Therapeutics共同宣布基因编辑疗法产品CASGEVY™(Exagaglogene autotemcel)获英国药品监管机构MHRA有条件批准上市,用于治疗治疗镰状细胞病(SCD)和输血依赖性β-地中海贫血(TDT),是全球首款获批上市的CRISPR基因编辑药物

 

CASGEVY™疗法是基于CRISPR/Cas9系统的治疗方案,CRISPR/Cas9系统因为其简单性和易于RNA编程的潜力,是所有CRISPR-Cas系统中用于基因工程开发的最佳候选系统。目前基于CRISPR/Cas9系统的基因编辑技术已经成功应用于治疗、育种、合成生物学等各个领域。

 

CRISPR基因编辑技术,除了众所周知的CRISPR/Cas9体系外,CRISPR/Cas12a体系正凭借其独特的优势逐渐崭露头角。与CRISPR/Cas9体系相比,CRISPR/Cas12a体系在核酸酶结构域、向导RNA(gRNA)以及产生的DNA末端类型等方面都有着显著的差异,详见下表

 

除以上差异外,Cas12a在切割活性方面也与Cas9存在显著区别。Cas9仅具有顺式切割活性,用于DNA双链断裂。而Cas12a不仅具有顺式切割活性,还具备独特的反式切割活性,这使得它在基因编辑领域展现出更为广泛的应用潜力。

 

 

 

CRISPR/Cas12a切割活性

  01 

顺式切割活性

Cas12a由单个crRNA引导,当形成crRNA-Cas12a复合物时,它的构象会发生变化。然后,该复合物识别DNA非靶标链中特定的PAM位点。在距离PAM位点8个核苷酸(nt)的位置,RuVC结构域切割DNA靶标链,产生5’端的粘性突出末端。

02 

反式切割活性

Cas12a能够特异性地识别并切割双链DNA(dsDNA),随后释放单链脱氧核糖核酸酶(ssDNase)活性。这种活性使得Cas12a能够无差别地裂解附近的单链DNA(ssDNA)。因此,Cas12a系统可以与LAMP等核酸检测技术相结合,为核酸检测、病原体识别等领域提供高效、灵敏且便捷的工具,展现出巨大的应用前景。

 

 

基于CRISPR/Cas12a广泛的应用场景,翌圣镁孚泰生物ZymeEditor(点击了解更多)酶改造及发酵纯化工艺平台新开发了来源于细菌Agathobacter rectalis的ArCas12a,与其它Cas12a(LbCas12a/AsCas12a)相比,其具有更高的温度适应性(25-55℃),非常适用于基因组编辑及核酸检测等应用场景。

 

 

 

ArCas12a性能展示

 01

dsDNA高效体外切割

以dsDNA模板为靶标,加入ArCas12a、crRNA(存在与模板DNA序列互补的spacer区)进行体外切割,琼脂糖凝胶电泳检测切割效果。结果显示翌圣的ArCas12a在crRNA的引导下可高效的切割dsDNA(600 bp)产生两段切割产物(200 bp+400 bp)。

02

反式切割活性强,可用于核酸检测

以dsDNA模板为靶标,加入ArCas12a、crRNA(存在与模板DNA序列互补的spacer区)及单链DNA报告探针(含有荧光报告集团)进行体外切割,当ArCas12a与crRNA及靶标DNA形成复合体后会激活反式切割活性,切割单链DNA报告探针,从而发出荧光。结果显示,翌圣ArCas12a与crRNA及模板DNA形成复合体后具有反式切割活性,可剪切单链DNA。

 

 

03

无核酸外切酶残留

将底物DNA与10 pmol ArCas12a共同孵育,琼脂糖凝胶电泳检测,结果显示翌圣的ArCas12a无核酸外切酶残留。

 

 

04

无RNase残留

将底物RNA与5 pmol ArCas12a共同孵育,琼脂糖凝胶电泳检测,结果显示翌圣的ArCas12a无RNase残留。

 

 

 

产品推荐

 

产品分类

产品名称

产品货号

Cas12a

ArCas12a Nuclease

14702ES

Lbcpf1 (Cas12) Nuclease

11354ES

Fncpf1(Cas12) Nuclease

11353ES

Ascpf1(Cas12) Nuclease

11352ES

Cas12b

AapCas12b Nuclease

14808ES

Cas9

Cas9 Nuclease

14701ES

NLS-Cas9-EGFP Nuclease

11364ES

sgRNA合成

Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit

11355ES

 

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