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教你发表外泌体高分文章的套路

作者:上海吉凯基因医学科技股份有限公司 2019-08-08T15:38 (访问量:4614)

教你发表外泌体高分文章的套路


临床医生朋友们,是否还苦于写课题写文章没有好思路?Dr.S教你一招让你吃遍天,前几期我们介绍了肺癌肝癌胃癌的文章;今天我们解析一篇2016年发表在顶级杂志Cancer cell(IF=23.216分)上的文章,还是用我们经典的ABCD四要素模式来分析一下。同时教给大家如何发表与目前研究大热—外泌体相关的文章。

关键词:耐药、外泌体、lncRNA、肾癌


直入主题,我们先解读一下题目:
Exosome-Transmitted lncARSR Promotes SunitinibResistance in Renal Cancer by Acting as aCompeting Endogenous RNA

又是A基因通过B基因/信号通路C疾病中发挥D功能,今天就是要教你用这招4要素。

这是一篇经典的研究外泌体在肿瘤中发挥功能的文章,且听Ds.S娓娓道来。



A基因、C疾病的由来:

C疾病:本文章的研究肿瘤为前肾癌,这完全取决于临床医生的所在领域。

A基因的由来:舒尼替尼是治疗肾癌的有效药物,但患者会产生耐药性(非常经典的临床问题出发点)。解释耐药机制和寻找到新的治疗策略在临床中具有非常的研究价值(临床的重要意义)。lncARSR如何获得?在小鼠模型中经过舒尼替尼处理通过尾静脉获取舒尼替尼耐药的RCC细胞,然后进行lncRNAs芯片,最终通过RNAi实验确定出与舒尼替尼耐药相关的lncARSR(Fig1)。舒尼替尼治疗的肾癌患者,获取他们的血浆和组织检测lncARSR的表达量并判断其临床价值(Fig2)。




Fig1


Fig2



D功能:


lncARSR在耐药株细胞的外泌体表达。lncARSR被包入外泌体经过hnRNPA2B1介导(Fig2)。外泌体传送的lncARSR参与了舒尼替尼的耐药过程(Fig3)。



Fig2


Fig3


B分子机制----lncRNAceRNA机制

lncARSR位于外泌体,既lncARSR位于细胞胞浆内,位于胞浆内的lncRNAs一般发挥ceRNA的调控机制。基于此,本文章则采用经典的ceRNA研究思路。(Fig4和Fig5)


Fig4


Fig5


Fig6

好了,又一个漂亮的故事诞生了,lncARSR通过竞争结合miR-34和miR-449导致AXL/c-MET的增加进而激活STAT3, AKT, and ERK 信号通路促进肾癌细胞对舒尼替尼的耐药;同时,lncARSR可以被包被至外泌体传递至舒尼替尼敏感株,导致敏感株的耐药(Fig6)。

现在大概了解如何用外泌体研究大概要怎么做了吧?那么如何搞定外泌体抽提和鉴定呢?我们也给大家准备好啦。想看的戳这里


章解读小结:

1. 要发表高分的SCI文章,ABCD模式一招鲜吃遍天,发现A基因(转录组测序或表达谱芯片),阐述其在C疾病中的D功能:细胞学功能和动物模型;以及B信号通路:分子机制(上游+下游)、功能恢复实验。

2. 对于待研基因,阐述其在某种疾病中的功能:临床相关性、细胞学功能、分子机制(上游+下游)、信号通路、功能恢复实验、动物模型、实验结论的临床回顾,关键在于“新基因”—新疾病—新机制。

根据吉凯基因的经验,从样本出发芯片,测序,质谱方法高通量筛选新功能基因的概率大约在10%左右,想要筛选验证得到一个新功能基因的难度非常大。吉凯基因历经3年,斥资上亿,已完成近6000个肿瘤相关基因的功能学筛选,从中找到明确的肿瘤功能标志基因若干,等待您来寻宝~~~



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